① 不同培養基營養與環境產生的雜菌
食用菌栽培培養基不同產生不同的雜菌。
糖份含量高、偏酸、水分過大、溫度高：木霉、綠霉、鏈孢霉、帚狀菌
水分過大、溫度高：美發菌、鬼傘、炭角菌
微酸---微堿：毛霉、根霉、黃曲霉
干燥。溫高：多為多孔菌、裂褶菌、紅栓菌等
② 不同滅菌方式產生的雜菌之分類
食用菌栽培有熟料、生料、發酵料之分。
熟料、生料、發酵料所形成的培養基環境產生的雜菌歸類：
熟料：木霉、綠霉、鏈孢霉、帚狀菌
發酵料：美發菌、鬼傘、炭角菌
生料：毛霉、根霉、黃曲霉
段木栽培雜菌：多為多孔菌、裂褶菌等
③ 熟料雜菌的產生原理與防治
經過無菌處理的培養料，很容易被最先侵染的某一種雜菌占領，得到全部的養分。熟料雜菌特點：發菌速度快、往往早于食用菌菌絲的生長、消耗的營養分與栽培食用菌相同，并且容易使菌袋腐爛。熟料上霉菌一般都是偏酸性，料內水分偏大、糖分偏大和高溫高濕情況下生成。
熟料中雜菌的預防與防治：既然是熟料就要“熟”，滅菌要徹底。接種也要嚴格，接種箱密閉性一定要好。接種箱盡量放在干燥、干凈、密閉性好的房間內；接種環節也要嚴格無菌操作；菌種在使用前一定要進行挑選及處理；接種人員接種前應該用75%的酒精對雙手及各接種器具進行嚴格的消毒。接種動作要輕盈、熟練快捷，接種量要足。
培養好的菇段防治：木霉，石灰處理，并加強通風，降低水分。鏈孢霉，及時清理，深埋密閉炭燒。
④ 發酵料中產生雜菌的原理與防治：發酵料中產生雜菌主要有放線菌、鬼傘、雞爪菌、美發菌。原理：發酵過程是一個多種微生物共同存在的過程，發酵頭3d，由于料內大量氨氣產生，雜菌較少。
⑤ 生料中雜菌產生的原理與防治：與對于沒有經過發酵和高溫濕熱滅菌的培養料，通常我們叫做生料。生料情況下所有代料栽培的木生類食用菌基本不能夠生長。但是，我們可以了解一下生料情況下出現的雜菌并且也有分類：60℃以下細菌；80~90℃多根霉、80~97℃多曲霉。
生料中雜菌產生的原因：是培養料沒有曬干，基料里的自由水沒有除去，滅菌無法徹底。 防治：基料曬干，嚴格無菌措施。
